Como nos outros jogos da série Yakuza você irá se mover dentro de uma cidade tipicamente japonesa da época dos samurais, interagindo com outros personagens que desvendarão os mistérios do enredo. A Sega promete que Yakuza 3 se passará em uma cidade com uma vida noturna bastante agitada e terá diversos pontos inovadores como cores mais dramáticas e a opção de combater com duas espadas e uma lâmina gigantesca (aguardamos mais sangue!). O protagonista, Kazumanosuke, terá o codinome de Musashi Miyamoto, o mais famoso Samurai da história japonesa